本田飛度的安全配置很豐富。

被動安全方面，全車搭載 6 安全氣囊，包括前排 i-SRS 智能雙安全氣囊、前排側安全氣囊、前后排貫穿式側安全氣簾，能為駕乘人員提供全方位保護。車身應用 ACE 高級兼容性車身結構，980Mpa 以上的高強度鋼材適用范圍達 18%，更高強度的車身結構提升了被動安全屬性。

主動安全方面，新款飛度搭載 Honda SENSING 安全超感系統(tǒng)，ACC 主動巡航控制系統(tǒng)優(yōu)化，遇到前車突然剎車能平穩(wěn)制動。LKAS 車道保持輔助系統(tǒng)在路況不良、視線不佳時能更好識別白線并強化控制邏輯。RDM 車道偏移抑制系統(tǒng)在駕駛者出現(xiàn)異常駕駛情況時強化控制。CMBS 碰撞緩解制動系統(tǒng)增加可判斷車輛前方是否存在自動兩輪車靜止或行駛的場景，強化碰撞控制。

此外，還配備 ABS 防抱死制動系統(tǒng)、EBD 電子制動力分配系統(tǒng)、VSA 車身穩(wěn)定控制系統(tǒng)等，有效提高車輛在各種路況下的操控和安全性能。

全系標配胎壓監(jiān)測、車身穩(wěn)定系統(tǒng)、坡道輔助、前排正面和側面安全氣囊。新增車道偏離警示、車道保持輔助系統(tǒng)、自適應巡航控制、行人碰撞預警、倒車影像及自動泊車等配置，能更好保障行車安全。