大眾全新桑塔納的安全配置非常豐富。

被動安全配置上，全車高強度鋼占比高，有的車型能達到 78%以上，車身堅固可抵御碰撞沖擊。配備多個安全氣囊，如 6 個、7 個甚至 9 個，包含頭部氣簾、前排側(cè)氣囊、前后排頭部氣囊等，還有預(yù)緊式安全帶。

主動安全配置方面，搭載全新 ESP 車身動態(tài)電子穩(wěn)定系統(tǒng)，能在車輛轉(zhuǎn)向不足或過度時迅速反應(yīng)保持車身平衡。配有 HBA 智能制動系統(tǒng)、XDS 差速器讓行駛更平穩(wěn)。還有 HHC 坡道輔助控制系統(tǒng)、Front Assist 前方安全輔助系統(tǒng)，檢測到可能碰撞危險會發(fā)出警報。

部分車型有主動剎車、盲區(qū)偵測系統(tǒng)、自適應(yīng)遠近光、感應(yīng)雨刷等功能。

大燈采用 LED 光源，照明效果好。標配 TPMS 胎壓檢測系統(tǒng)、智能胎壓監(jiān)測系統(tǒng)實時監(jiān)測胎壓。

還有定速巡航、多功能方向盤、上坡輔助、發(fā)動機啟停、車內(nèi) PM2.5 過濾裝置等實用配置，進一步提升行車安全性和舒適性。