新車上牌照的時候，合格證原件是要交給車管所保管的，會存放在車輛檔案的，車管所主要負責承辦機動車注冊、變更、轉移、抵押、注銷登記。

車管所保管。車輛證書在車輛交付時交付給車主。新車上牌時，原車輛合格證需由車輛管理部門備案保存。只有有合格證的汽車才能滿足國家對機動車設備質量和相關標準的要求。自2018年8月1日起，機動車合格證可網(wǎng)上辦理?！蛾P于網(wǎng)上辦理機動車認證業(yè)務有關事項的通知》指出，自2018年8月1日起，工業(yè)和信息化部裝備中心開通機動車認證業(yè)務平臺(以下簡稱業(yè)務平臺)，梳理簡化業(yè)務辦理所需材料清單，方便相關企業(yè)和個人網(wǎng)上辦理認證業(yè)務。業(yè)務平臺的具體業(yè)務功能包括:新企業(yè)備案、企業(yè)信息變更、證書正面樣式備案(僅限國內機動車生產(chǎn)企業(yè))、證書正面樣式變更(僅限國內機動車生產(chǎn)企業(yè))、證書系統(tǒng)U盾申請、新子公司企業(yè)備案、子公司企業(yè)信息變更、證書系統(tǒng)用戶信息檢索、配置信息系統(tǒng)開通(新增或變更生產(chǎn)企業(yè))、免稅圖集系統(tǒng)開通、票據(jù)關聯(lián)系統(tǒng)開通、證書批量修改注銷申請。/